Der Rechnungshof überprüft als unabhängige Bundes- oder Landesbehörde das Verwaltungshandeln auf Ordnungsmäßigkeit und die Einhaltung der Grundsätze der Wirtschaftlichkeit und Sparsamkeit. Die Rechnungshöfe prüfen die Wirtschafts- und Haushaltsführung der entsprechenden Gebietskörperschaft. Nach Angaben des Rechnungshofes (LRH) strich das Land im Zuge der Schuldenbremse zwar seit 2011 etwa 3000 Stellen, richtete aber zeitgleich mehr als 3300 Stellen neu ein. Der Oberste Rechnungshof (ORH) prangert in einem Gutachten zur Bayern-Ei-Affäre Mängel in der bayerischen Lebensmittelüberwachung an.