Nach 60 Jahren engagieren sich die Malteser in der Diözese in acht Gliederungen: Neben Eichstätt, Sitz der Diözesangeschäftsstelle, sind dies Aurach, Heideck, Ingolstadt, Neumarkt, Preith, Solnhofen und Wendelstein. Schwerpunkte der Arbeit sind Angebote rund um Hospiz und Trauer sowie die Seniorenarbeit. Viel Anerkennung erhält die Flüchtlingshilfe der Malteser. Die Malteser Jugend ist in der Diözese Eichstätt sehr aktiv; ebenso der Sanitätsdienst. Einen guten Ruf genießt zudem die Ausbildung durch die Malteser, sei es für Ehrenamtliche oder im Bereich Erste Hilfe. Erfolgreich agieren zudem die hauptamtlichen Dienste Fahrdienst, Hausnotruf und Schulbegleitdienst.